生物信息计算

1 (p1): 第1章 生物医学信息的知识库工程技术
1 (p1-1): 1.1 现有生物医学信息知识库系统简介
3 (p1-2): 1.2 本体
3 (p1-2-1): 1.2.1 本体简介
3 (p1-2-2): 1.2.2 GO基因本体
7 (p1-2-3): 1.2.3 本体建模
16 (p1-2-4): 1.2.4 本体工程
19 (p1-3): 1.3 基于本体构建的自动辅助诊疗系统
19 (p1-3-1): 1.3.1 自动辅助诊疗系统简介
20 (p1-3-2): 1.3.2 系统结构
21 (p1-3-3): 1.3.3 规则编辑和推理
23 (p1-4): 参考文献
25 (p2): 第2章 高性能计算与生物医药大数据
25 (p2-1): 2.1 高性能计算机
31 (p2-2): 2.2 基于高性能计算的生物医药大数据技术简介
34 (p2-3): 2.3 基因工程——人类全基因组重测序软件流水线
38 (p2-4): 2.4 基因大数据——Hadoop和Spark加速基因大数据挖掘
39 (p2-5): 2.5 药物大数据与药物研发——大规模虚拟药物筛选平台
40 (p2-6): 2.6 肿瘤信息学大数据分析平台
41 (p2-7): 2.7 生物医药文献大数据挖掘技术
42 (p2-8): 2.8 国家三大超算中心上目前部署的生物医药大数据健康平台
42 (p2-8-1): 2.8.1 天津超算：构建生物医药研发平台和基因组学数据分析平台
42 (p2-8-2): 2.8.2 长沙超算：智慧医疗云平台
43 (p2-8-3): 2.8.3 广州超算：生物计算与个性化医疗应用服务平台
45 (p2-9): 参考文献
46 (p3): 第3章 健康云计算
46 (p3-1): 3.1 云计算的基本概念
47 (p3-2): 3.2 云计算体系架构及结构
47 (p3-2-1): 3.2.1 云计算体系架构
50 (p3-2-2): 3.2.2 云计算体结构
51 (p3-3): 3.3 云计算中的关键技术
51 (p3-3-1): 3.3.1 虚拟化技术
53 (p3-3-2): 3.3.2 海量数据存储与处理技术
58 (p3-4): 3.4 健康云计算体系结构
59 (p3-5): 3.5 健康云计算的数据采集与分析技术
60 (p3-5-1): 3.5.1 可穿戴心电信号检测
67 (p3-5-2): 3.5.2 基于可穿戴传感器的行为监测
73 (p3-5-3): 3.5.3 人员定位与位置服务
74 (p3-6): 3.6 健康云计算的典型应用
75 (p3-7): 参考文献
76 (p4): 第4章 生物影像处理
76 (p4-1): 4.1 医学影像简介
76 (p4-1-1): 4.1.1 基本概念
77 (p4-1-2): 4.1.2 发展历史
78 (p4-2): 4.2 医学图像预处理
78 (p4-2-1): 4.2.1 图像去噪
80 (p4-2-2): 4.2.2 图像增强
84 (p4-3): 4.3 医学图像配准与融合
84 (p4-3-1): 4.3.1 基于互信息的医学图像配准
85 (p4-3-2): 4.3.2 基于多尺度的医学图像融合
86 (p4-4): 4.4 医学图像分割
87 (p4-4-1): 4.4.1 分水岭图像分割
89 (p4-4-2): 4.4.2 阈值分割算法
90 (p4-4-3): 4.4.3 基于区域增长的图像分割
92 (p4-4-4): 4.4.4 基于聚类的图像分割
93 (p4-4-5): 4.4.5 图论法
94 (p4-5): 4.5 医学图像特征选择
95 (p4-5-1): 4.5.1 基于联合互信息的特征选择算法
97 (p4-5-2): 4.5.2 基于灰色关联分析特征选择算法
100 (p4-6): 4.6 医学图像分类诊断
100 (p4-6-1): 4.6.1 基于统计学的分类方法
101 (p4-6-2): 4.6.2 基于机器学习的分类方法
102 (p4-6-3): 4.6.3 基于人工神经网络的分类方法
103 (p4-7): 参考文献
105 (p5): 第5章 基因序列比对
105 (p5-1): 5.1 序列比对的基础知识
107 (p5-1-1): 5.1.1 编辑距离
108 (p5-1-2): 5.1.2 打分矩阵
112 (p5-1-3): 5.1.3 空位罚分模型
113 (p5-2): 5.2 双序列比对
114 (p5-2-1): 5.2.1 点阵图
115 (p5-2-2): 5.2.2 全局比对的动态规划算法
118 (p5-2-3): 5.2.3…